宗萨钦哲仁波切于2000年代初开始改建位于不丹迭瓦塘的确吉嘉措佛学院，以实现其外祖父索南桑波喇嘛 (1888-1982)的愿望。索南喇嘛很久以前建了一座小庙宇，希望有朝一日这片土地能用作建立佛学院。自2015年以来，确吉嘉措佛学院一直作为一所佛教教育学院运作，提供传统和现代的佛学院教育。 在传承蒋扬钦哲旺波利美（不分教派）运动的佛教哲学和方法论课程和培训的同时，确吉嘉措佛学院积极探索和实施佛学院教育的创新方法。为了促进积极参与社会、受过教育并了解周围世界的僧侣，学院提供一系列着重于将艺术和环境融入课堂的替代、全面课程。
但真正令这所佛学院与众不同的，是它对于环保与当地社区的承诺。该承诺透过与南方人教育计划(Lhomon Education Initiative) 和桑祝琼卡社区运动 (Samdrup Jongkhar Initiative )的合作落实。确吉嘉措佛学院是率先采用“零垃圾”方针的寺院之一。例如，寺院为社区提供的众多服务之一是举办法会，其中通常有供养食物和其他物品等。 僧侣们不提倡供养常用的包装饼干和零食，而是鼓励提供自制黄油、当地种植的有机蔬菜和传统编织品。确吉嘉措佛学院在社区的精神和社会福祉中持续发挥着重要的作用。