历史悠久，跨越数个世纪的宗萨寺是钦哲传承的发源地。它于西元746年由一位苯教喇嘛创立，而后于公元1275年被一位萨迦派高僧所接管，到1871年它成为了不分教派“利美”运动的中心。正是在那年，伟大的学者和修行者，也是钦哲传承的开创者蒋扬钦哲旺波（1820-1892）在宗萨寺下方的平原上创立了宗萨康杰佛学院。其后在其转世宗萨确吉罗卓（1893-1959）的领导下，佛学院原有的结构得到扩展，并成为重要的全面佛教学习中心，支持佛教所有派别的传承。
在宗萨佛学院的全盛时期，其范围涵盖了23所寺院及许多隐修处和闭关中心。蒋贡康楚、秋吉林巴和蒋扬钦哲旺波的利美图书馆，典藏了大量的不分教派文献，使僧侣们和所有人都能接触到各个教派的教法。佛学院在1960年代被毁，但自1986年起，由于班禅喇嘛的遗愿，宗萨佛学院在宗萨钦哲仁波切的赞助下开始重建。新佛学院的基本结构于1989年竣工。
目前佛学院的课程，是由蒋扬钦哲确吉罗卓在20世纪初所设计，包括佛教经典如三藏、释论和密续，以及诗歌、占星学及医药。宗萨佛学院继续在德格社区发挥着重要的角色。